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1. Mybatis是一个不完全的ORM（对象关系映射）框架，因为它需要程序员自己编写sql语句，而Hibernate是一个完全的ORM框架。

2. Mybatis学习门槛低，简单易学，而Hibernate较为复杂，不易精通。

3. Mybatis可以直接编写原生态的sql,可以严格控制sql执行性能，进行更细致的sql优化，灵活度高，非常适合对关系型数据模型不高的软件开发，例如互联网软件，企业运营类软件，而Hibernate不能编写sql语句，灵活度不高，但对于关系模型要求高的软件，可以节省很多代码的开发，提高开发效率。

4. Mybatis本身的缓存机制不佳，而Hibernate有更好的一级缓存和二级缓存，而且还可以使用第三方插件，利于Hibernate使用的就是Ehcache.

5. Mybatis移植性不好，有自己编写的sql语句 ，当面对不同类型的数据库时需要修改sql语句，而Hibernate的hql数据库，移植性好，因为它里面没有sql语句。

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